Do wprowadzania metody MuBaBaO potrzebne są odpowiednie narzędzia. Z tego powodu przy Muzeum, powołany został Instytut Innowacji Pedagogicznych w którym powstają prototypy wynalazków i zabawek edukacyjnych. Wiele wynalazków stworzonych zostało na bazie unikalnej kolekcji opowiadania obrazkowego z różnych części świata. Każda zabawka wykorzystywana jest najpierw podczas warsztatów prowadzonych przez naszych edukatorów. Szczególną cechą zabawek MuBaBaO jest to, że rozwijają wyobraźnię oraz kształtują pozytywne wartości. Stale opracowujemy  nowe prototypy.


W skład naszych zabawek wchodzą:
1. zestawy do tworzenia papierowych teatrzyków, 2. zestawy do tworzenia teatrzyków Kamishibai, 3. zestawy do tworzenia teatrzyków cieni,
4. drewniane klocki konstrukcyjne,
5. klocki modelarskie
6. modele i mechanizmy do kreatywnego modelarstwa i robotyki.

Nasze zabawki można zamawiać pojedynczo lub w pakietach dla szkół i przedszkoli